PLOS Biology 期刊在線發表了題為《斑馬魚生物鐘的活體單細胞成像》的研究論文。該研究由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心(神經科學研究所)、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室嚴軍研究組、何杰研究組與安徽醫科大學附屬第一醫院教授李元海合作完成。該研究成功構建了可以活體實時觀測斑馬魚單細胞節律的報告基因系統,并 3月14日,PLOS Biology 期刊在線發表了...
加州理工學院研究人員在《自然·方法》上發表研究介紹,其研制的聲學報告基因(acoustic reporter genes)靈敏度提升,能夠對單個細胞進行成像研究。報告基因是一段特殊的DNA片段,通常編碼熒光蛋白,可插入基因組內用于檢測特定基因表達情況。比如,將報告基因插在神經元發育基因旁邊,當神經元基因被激活時就會產生熒光蛋白分子。而熒光報告基因一大缺點是光無法穿透到活體組織的深處。加州理工研...
單細胞基因組測序是生命科學與生物技術的共性使能技術之一,但其推廣應用面臨諸多瓶頸。一方面,單個細胞的核酸含量低,為滿足測序所需核酸量通常須大幅增加擴增循環數,這將極度放大基因組DNA擴增的偏好性,從而大幅度降低單細胞全基因組覆蓋率;同時,單細胞的分離獲取、裂解、擴增等過程通常十分繁瑣,其操作困難、易于污染。為此,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心開發出一種模塊式的可尋址動態液...
在一項新的研究中,來自中國浙江大學等研究機構的研究人員朝構建全面的人類單細胞圖譜邁出了一大步。相關研究結果在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在這篇論文中,他們描述了他們對志愿者捐贈的50多萬個細胞的RNA進行測序,以及如何處理這些信息從而以一種可用于單細胞圖譜的方式進行...
細胞免疫是控制細胞內病原體的關鍵,但在進化的人類免疫反應中,個體細胞動力學和細胞-細胞協同性仍然知之甚少。單細胞RNA測序(scRNA-seq)是一個強有力的工具,可以用來分析健康和疾病中復雜的多細胞行為,并鑒定可測試的治療靶點。將其應用于縱向樣本可以提供一個揭示與疾病進展演變相關的細胞因子的機會,而不會潛在地混淆個體間的多樣性。圖片來源:https://cn.bing.com為此來自哈佛和MIT...
盡管遺傳學和基因組學的進展揭示了許多與疾病相關的基因突變,但醫生和研究人員仍然面臨著將這些突變與實際致病過程聯系起來的棘手挑戰。再加上單細胞生物學的不斷發展,它能在特定時刻檢測每個細胞的基因和/或蛋白質的表達,這項任務變得更加艱巨。現在,辛辛那提兒童醫院醫學中心的研究人員在Nature雜志上發表了一篇研究報告,他們開發了一種分子工作流程,利用單細胞方法來了解與特定患者基因突變相關的分子通路。科學家...
為了確保單細胞RNA測序能夠使用最好的方法,日前研究人員對13種方法進行了基準性的測試,一項刊登在國際雜志Nature Biotechnology上的研究報告中,來自西班牙的科學家們通過研究發現,日本理化所開發的Quartz-seq2方法或許是進行單細胞RNA測序的最佳手段。圖片來源:CC0 Public Domain此前,用于基因組分析的方法缺乏一定的基準,這就會在后來的分析過程中產生許多問題,...
頂尖學術期刊《細胞》在線發表了多篇論文。第一篇論文來自哈佛大學莊小威教授與Bogdan Bintu教授的聯合團隊。科學家們開發了一種全基因組范圍內的成像技術,能夠看清染色質的3D結構與轉錄活性。研究人員們在摘要中指出,染色質的3D結構調控了許多基因組的功能。如果有一款工具能夠看清染色質的3D結構,無疑將幫助我們更好地理解其生理功能。為此,研究人員 頂尖學術期刊《細胞》在線發表...
近日,發表在《Nature》上的一項研究中,來自瑞典卡羅林斯卡醫學院領導的研究團隊利用單細胞技術開發出一份詳細的小鼠胚胎大腦發育分子圖譜。利用這份圖譜,研究人員已經識別出近800種在胎兒發育過程中活躍的不同細胞,這比已知的多出許多倍。在這項研究中,研究人員跟蹤了小鼠的大腦發育,從大腦剛剛形成的第七天到懷孕結束的第18天。利用單細胞技術,他們能夠確定胎兒發育期間大腦的詳細構成,如:存在哪...
耶魯大學醫學院的科學家們正在利用單細胞RNA測序來研究SARS-CoV-2如何與宿主細胞相互作用。心血管醫學和計算機科學部醫學助理教授David van Dijk博士和實驗室醫學和免疫生物學助理教授Craig Wilen博士利用被感染的人類支氣管上皮細胞(HBECs)的單細胞RNA序列數據來確定病毒如何感染和改變健康細胞。在bioRxiv預印本服務器上發表的這項研究中,作者確定了纖毛細胞是SARS...
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