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來自大腸桿菌的內切酶III（Nth）蛋白同時充當N-糖基化酶和AP裂解酶。N-糖基化酶的活性從雙鏈DNA中釋放出受損的嘧啶，產生一個堿基（AP位點）。酶的AP裂解酶活性裂解3'到AP位點，留下5'磷酸和3'開環糖。內切酶III識別和去除的一些受損堿基包括尿素、5，6-二羥胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲基乙二醇、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5，6-二氫嘧啶和甲基酒石酰脲。

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