2018年4月19日/生物谷BIOON/---在一項新的研究中，美國北卡羅萊納州立大學的Rodolphe Barrangou、Alexandra Crawley和AgBiome公司的James Henriksen開發出一種被稱作CRISPRdisco（CRISPR discovery）的自動化生物信息學工具，該工具旨在提高日益多樣化的CRISPR-Cas基因組編輯系統的實用性和可用性，并幫助科學家們鑒定出基因組中的CRISPR重復序列和cas基因。這種可免費獲得的軟件提供標準化的高通量分析方法來檢測CRISPR重復序列并準確地確定它們的類別、類型和亞型。相關研究結果于2018年4月9日在線發表在CRISPR Journal期刊上，論文標題為“CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems”。Barrangou也是CRISPR Journal期刊的主編。

CRISPR/Cas系統類型分布圖，圖片來自CRISPR Journal, doi:10.1089/crispr.2017.0022。

在這項研究中，這些研究人員利用CRISPRdisco對來自美國國家生物信息技術中心參考序列數據庫（NCBI RefSeq database）的2777個完整基因組進行分析，從中鑒定潛在的CRISPR-Cas系統，并對它們進行分類。他們強調了能夠區分完整的和不完整的CRISPR系統的重要性，確定了潛在完整的和功能性的CRISPR-Cas系統之間在體內的關聯性，并且利用計算機模擬（in silico）確定了CRISPR-Cas多樣性。重要的是，所有人都可通過GitHub網絡平臺（一個面向開源及私有軟件項目的托管平臺）獲得這個軟件，并且該軟件能夠讓新手分析和描述各種基因組數據集中的CRISPR-Cas系統。

CRISPR Journal期刊執行編輯Kevin Davies博士說，“新的生物信息學工具、程序和數據庫正在協助推動CRISPR革命，而且我們很樂意為驗證其中的一些重要平臺提供論壇。”（生物谷 Bioon.com）

參考資料：

Crawley Alexandra B. , Henriksen James R. , and Barrangou Rodolphe. CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems. CRISPR Journal, Published Online:9 Apr 2018, doi:10.1089/crispr.2017.0022